biobb_analysis

• gromacs package
  • Submodules
  • gromacs.gmx_cluster module
    • GMXCluster
      • GMXCluster.check_data_params()
      • GMXCluster.launch()
    • gmx_cluster()
    • main()
  • gromacs.gmx_rms module
    • GMXRms
      • GMXRms.check_data_params()
      • GMXRms.launch()
    • gmx_rms()
    • main()
  • gromacs.gmx_energy module
    • GMXEnergy
      • GMXEnergy.check_data_params()
      • GMXEnergy.create_instructions_file()
      • GMXEnergy.launch()
    • gmx_energy()
    • main()
  • gromacs.gmx_rgyr module
    • GMXRgyr
      • GMXRgyr.check_data_params()
      • GMXRgyr.launch()
    • gmx_rgyr()
    • main()
  • gromacs.gmx_image module
    • GMXImage
      • GMXImage.check_data_params()
      • GMXImage.launch()
    • gmx_image()
    • main()
  • gromacs.gmx_trjconv_str module
    • GMXTrjConvStr
      • GMXTrjConvStr.check_data_params()
      • GMXTrjConvStr.launch()
    • gmx_trjconv_str()
    • main()
  • gromacs.gmx_trjconv_str_ens module
    • GMXTrjConvStrEns
      • GMXTrjConvStrEns.check_data_params()
      • GMXTrjConvStrEns.launch()
    • gmx_trjconv_str_ens()
    • main()
  • gromacs.gmx_trjconv_trj module
    • GMXTrjConvTrj
      • GMXTrjConvTrj.check_data_params()
      • GMXTrjConvTrj.launch()
    • gmx_trjconv_trj()
    • main()
• ambertools package
  • Submodules
  • ambertools.cpptraj_average module
    • CpptrajAverage
      • CpptrajAverage.check_data_params()
      • CpptrajAverage.create_instructions_file()
      • CpptrajAverage.launch()
    • cpptraj_average()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_bfactor module
    • CpptrajBfactor
      • CpptrajBfactor.check_data_params()
      • CpptrajBfactor.create_instructions_file()
      • CpptrajBfactor.launch()
    • cpptraj_bfactor()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_convert module
    • CpptrajConvert
      • CpptrajConvert.check_data_params()
      • CpptrajConvert.create_instructions_file()
      • CpptrajConvert.launch()
    • cpptraj_convert()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_dry module
    • CpptrajDry
      • CpptrajDry.check_data_params()
      • CpptrajDry.create_instructions_file()
      • CpptrajDry.launch()
    • cpptraj_dry()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_image module
    • CpptrajImage
      • CpptrajImage.check_data_params()
      • CpptrajImage.create_instructions_file()
      • CpptrajImage.launch()
    • cpptraj_image()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_mask module
    • CpptrajMask
      • CpptrajMask.check_data_params()
      • CpptrajMask.create_instructions_file()
      • CpptrajMask.launch()
    • cpptraj_mask()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_rgyr module
    • CpptrajRgyr
      • CpptrajRgyr.check_data_params()
      • CpptrajRgyr.create_instructions_file()
      • CpptrajRgyr.launch()
    • cpptraj_rgyr()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_rms module
    • CpptrajRms
      • CpptrajRms.check_data_params()
      • CpptrajRms.create_instructions_file()
      • CpptrajRms.launch()
    • cpptraj_rms()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_rmsf module
    • CpptrajRmsf
      • CpptrajRmsf.check_data_params()
      • CpptrajRmsf.create_instructions_file()
      • CpptrajRmsf.launch()
    • cpptraj_rmsf()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_slice module
    • CpptrajSlice
      • CpptrajSlice.check_data_params()
      • CpptrajSlice.create_instructions_file()
      • CpptrajSlice.launch()
    • cpptraj_slice()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_snapshot module
    • CpptrajSnapshot
      • CpptrajSnapshot.check_data_params()
      • CpptrajSnapshot.create_instructions_file()
      • CpptrajSnapshot.launch()
    • cpptraj_snapshot()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_strip module
    • CpptrajStrip
      • CpptrajStrip.check_data_params()
      • CpptrajStrip.create_instructions_file()
      • CpptrajStrip.launch()
    • cpptraj_strip()
    • main()
  • ambertools.cpptraj_input module
    • CpptrajInput
      • CpptrajInput.create_instrucions_file()
      • CpptrajInput.launch()
    • cpptraj_input()
    • main()